Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFYVE27Q5T4F4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms