Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP170Q5SW79 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms