Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms