Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SDK2Q58EX2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SDK2Q58EX2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms