Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SFT2D3Q587I9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFT2D3Q587I9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms