Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ESCO2Q56NI9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms