Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP29Q52LW3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARHGAP29Q52LW3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms