Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A12Q504Y0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A12Q504Y0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms