Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf46Q504U0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms