Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN3Q4LDR2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms