Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVEP1Q4LDE5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms