Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2CQ496J9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms