Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms