Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms