Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FHOD3Q2V2M9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms