Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
QSER1Q2KHR3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
QSER1Q2KHR3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
QSER1Q2KHR3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms