Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC142Q17RM4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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