Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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