Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms