Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSCN1Q16658 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSCN1Q16658 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSCN1Q16658 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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