Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGISQ16647 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms