Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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