Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK5Q16478 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
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