Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
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