Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRK1Q15835 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRK1Q15835 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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