Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF1Q15637 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SF1Q15637 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF1Q15637 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF1Q15637 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF1Q15637 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF1Q15637 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF1Q15637 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF1Q15637 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF1Q15637 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF1Q15637 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SF1Q15637 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF1Q15637 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF1Q15637 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF1Q15637 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SF1Q15637 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF1Q15637 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF1Q15637 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF1Q15637 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF1Q15637 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF1Q15637 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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SF1Q15637 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF1Q15637 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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SF1Q15637 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF1Q15637 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SF1Q15637 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF1Q15637 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF1Q15637 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF1Q15637 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF1Q15637 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF1Q15637 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF1Q15637 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF1Q15637 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF1Q15637 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF1Q15637 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF1Q15637 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF1Q15637 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF1Q15637 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF1Q15637 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF1Q15637 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF1Q15637 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF1Q15637 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF1Q15637 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SF1Q15637 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SF1Q15637 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF1Q15637 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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SF1Q15637 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF1Q15637 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF1Q15637 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SF1Q15637 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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