Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF4Q15306 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF4Q15306 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF4Q15306 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF4Q15306 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF4Q15306 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF4Q15306 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF4Q15306 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF4Q15306 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF4Q15306 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF4Q15306 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IRF4Q15306 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF4Q15306 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms