Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX17Q15036 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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