Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM2Q15035 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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