Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7AQ13946 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE7AQ13946 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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