Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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