Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTB1Q13884 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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