Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1A4Q13733 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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