Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PEX6Q13608 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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