Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC1Q13547 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC1Q13547 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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