Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF4BQ13523 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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