Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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