Protein–RNA interactions for Protein: Q13201

MMRN1, Multimerin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMRN1Q13201 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMRN1Q13201 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMRN1Q13201 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms