Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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