Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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