Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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FOXC1Q12948 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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FOXC1Q12948 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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FOXC1Q12948 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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FOXC1Q12948 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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FOXC1Q12948 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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FOXC1Q12948 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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FOXC1Q12948 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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