Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms