Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIAQ12857 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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