Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 RPS25AYGR027C 327 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 CFD1YIL003W 882 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 POR2YIL114C 846 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 ATG36YJL185C 882 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 AIM29YKR074W 468 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 PDR17YNL264C 1053 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 RPS19BYNL302C 435 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 MRM1YOR201C 1239 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YPL035CYPL035C 348 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 TAF14YPL129W 735 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YBR209WYBR209W 318 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YCL012CYCL012C 405 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 BIK1YCL029C 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 GEM1YAL048C 1989 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 HRQ1YDR291W 3234 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 MPP10YJR002W 1782 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 AEP1YMR064W 1557 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 TRM12YML005W 1389 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YME1YPR024W 2244 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 PMA1YGL008C 2757 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 CWC21YDR482C 408 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 SCS2YER120W 735 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YGR107WYGR107W 450 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YHR097CYHR097C 1101 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 DFG10YIL049W 762 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 TPK3YKL166C 1197 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 CTK3YML112W 891 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YBL055CYBL055C 1257 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YBR090CYBR090C 369 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 TAE1YBR261C 699 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 RET1YOR207C 3450 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 KRE2YDR483W 1329 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 FAR8YMR029C 1572 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 SIA1YOR137C 1869 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 HSP82YPL240C 2130 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 SEN54YPL083C 1404 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YEL057CYEL057C 702 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 FRA2YGL220W 363 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YGR017WYGR017W 894 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YGR025WYGR025W 303 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 SPG1YGR236C 288 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YHL049CYHL049C 816 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 RPE1YJL121C 717 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 RHO4YKR055W 876 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 OST2YOR103C 393 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 LSC1YOR142W 990 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 INA17YPL099C 549 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YOP1YPR028W 543 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 ILV1YER086W 1731 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 SPC97YHR172W 2472 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 MRS1YIR021W 1092 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YJR111CYJR111C 852 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YJR146WYJR146W 354 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YKL223WYKL223W 333 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 KTR2YKR061W 1278 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YLR126CYLR126C 756 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YML108WYML108W 318 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 RPL13BYMR142C 600 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 SPN1YPR133C 1233 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 GPD2YOL059W 1323 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YIR007WYIR007W 2295 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 PIG2YIL045W 1617 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 TSL1YML100W 3297 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 HNT1YDL125C 477 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YER097WYER097W 330 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 DOC1YGL240W 753 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 PGU1YJR153W 1086 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 BSC3YLR465C 309 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 GUA1YMR217W 1578 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 VMA3YEL027W 483 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YER076CYER076C 909 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YGL102CYGL102C 429 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YGL108CYGL108C 423 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 PDX1YGR193C 1233 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 ATG10YLL042C 504 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 ARG80YMR042W 534 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YBR124WYBR124W 360 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YTP1YNL237W 1380 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 ICP55YER078C 1536 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 MET7YOR241W 1647 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 HIS7YBR248C 1659 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 UBA1YKL210W 3075 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 SKO1YNL167C 1944 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YJL220WYJL220W 453 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 MCM1YMR043W 861 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 TFB2YPL122C 1542 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 MCP2YLR253W 1710 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 CRZ1YNL027W 2037 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 PAM1YDR251W 2493 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 HPR1YDR138W 2259 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 MNN5YJL186W 1761 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 NUP53YMR153W 1428 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 ADE12YNL220W 1302 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YPR148CYPR148C 1308 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YJL119CYJL119C 324 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YJR079WYJR079W 330 nt5.35□□□□□ -1.55
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