Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 PUF6YDR496C 1971 nt2.76□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 MET10YFR030W 3108 nt2.76□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 FMP48YGR052W 1110 nt2.76□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 SDH3YKL141W 597 nt2.76□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 SEC65YML105C 822 nt2.76□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 CHO2YGR157W 2610 nt2.76□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 FLO11YIR019C 4104 nt2.76□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 BPT1YLL015W 4680 nt2.75□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 PFF1YBR074W 2931 nt2.75□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 CPA2YJR109C 3357 nt2.75□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 YDR209CYDR209C 414 nt2.75□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 COG1YGL223C 1254 nt2.75□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 RPL27AYHR010W 411 nt2.75□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 GGA1YDR358W 1674 nt2.75□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 TGL1YKL140W 1647 nt2.75□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 ECM29YHL030W 5607 nt2.74□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 YTA7YGR270W 4140 nt2.74□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 CHS3YBR023C 3498 nt2.74□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 SEC7YDR170C 6030 nt2.74□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.74□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.74□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 YHR180WYHR180W 492 nt2.74□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 YJL175WYJL175W 513 nt2.74□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 RNA1YMR235C 1224 nt2.74□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 RGP1YDR137W 1992 nt2.74□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 ADY4YLR227C 1482 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 CAF130YGR134W 3369 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 RIM1YCR028C-A 408 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 TOS8YGL096W 831 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 RPS23AYGR118W 438 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 COX23YHR116W 456 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 OSW5YMR148W 447 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 PPA2YMR267W 933 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 RPA43YOR340C 981 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 RPS23BYPR132W 438 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 RIB5YBR256C 717 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 BSD2YBR290W 966 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 YDR444WYDR444W 2064 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 CDC55YGL190C 1581 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 UBP10YNL186W 2379 nt2.73□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 FLO5YHR211W 3228 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 SKT5YBL061C 2091 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 DTD1YDL219W 453 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 YLR297WYLR297W 390 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 RPC19YNL113W 429 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 PEX11YOL147C 711 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 DGA1YOR245C 1257 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 AFT2YPL202C 1251 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 YTH1YPR107C 627 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 snR42snR42 351 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 SLH1YGR271W 5904 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 RRN7YJL025W 1545 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 BDP1YNL039W 1785 nt2.72□□□□□ -1.97
RTR2Q12378 YLR446WYLR446W 1302 nt2.71□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 DYN1YKR054C 12279 nt2.71□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 RAD55YDR076W 1221 nt2.71□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 APC9YLR102C 798 nt2.71□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 YPL014WYPL014W 1146 nt2.71□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 LCL1YPL056C 306 nt2.71□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 TRM1YDR120C 1713 nt2.71□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 MSM1YGR171C 1728 nt2.71□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 YER085CYER085C 522 nt2.7□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 YGR011WYGR011W 327 nt2.7□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 SDO1YLR022C 753 nt2.7□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 RCE1YMR274C 948 nt2.7□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.7□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.7□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 NIP7YPL211W 546 nt2.7□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 TIM12YBR091C 330 nt2.7□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 ALE1YOR175C 1860 nt2.7□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 VAS1YGR094W 3315 nt2.7□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 SWC4YGR002C 1431 nt2.69□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 YGR067CYGR067C 2415 nt2.69□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 RRT13YER066W 558 nt2.69□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 MOB2YFL034C-B 864 nt2.69□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 YBR116CYBR116C 528 nt2.69□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 NSA1YGL111W 1392 nt2.69□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 DAP2YHR028C 2457 nt2.69□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 SDS23YGL056C 1584 nt2.69□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 TRE2YOR256C 2430 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 NKP1YDR383C 717 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 YGR017WYGR017W 894 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 GRE3YHR104W 984 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 YLR326WYLR326W 723 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 MDJ2YNL328C 441 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 AIM39YOL053W 1188 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 CAT5YOR125C 702 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 HPA2YPR193C 471 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 BMT2YBR141C 1014 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 PRM15YMR278W 1869 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 IMH1YLR309C 2736 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 LAP2YNL045W 2016 nt2.68□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 NMD2YHR077C 3270 nt2.67□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 CDC40YDR364C 1368 nt2.67□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 ALG1YBR110W 1350 nt2.67□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 CDC26YFR036W 375 nt2.67□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 YGL193CYGL193C 312 nt2.67□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 SWD2YKL018W 990 nt2.67□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 ERP1YAR002C-A 660 nt2.67□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 MRPL16YBL038W 699 nt2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.3 ms