Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSL5	Q12186	STP22	YCL008C	1158 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YCL022C	YCL022C	516 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	GIP4	YAL031C	2283 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	FUI1	YBL042C	1920 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YOR1	YGR281W	4434 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	SMF1	YOL122C	1728 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	UBX3	YDL091C	1368 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YOR192C-A	YOR192C-A	1317 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YOR343W-A	YOR343W-A	1317 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	POL31	YJR006W	1464 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	RIM21	YNL294C	1602 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	SEO1	YAL067C	1782 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	ELO2	YCR034W	1044 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	CLB3	YDL155W	1284 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	RCR2	YDR003W	633 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	VPS74	YDR372C	1038 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	KEX1	YGL203C	2190 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	BET1	YIL004C	429 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	TPP1	YMR156C	717 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	TSR4	YOL022C	1227 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	TOA1	YOR194C	861 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	GDS1	YOR355W	1569 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	GZF3	YJL110C	1656 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	RAT1	YOR048C	3021 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	PHO5	YBR093C	1404 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	APM2	YHL019C	1818 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	HAP1	YLR256W	4509 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YER085C	YER085C	522 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	THI5	YFL058W	1023 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	THG1	YGR024C	714 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	LOH1	YJL038C	660 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	MRPL20	YKR085C	588 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	THI12	YNL332W	1023 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	POL30	YBR088C	777 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	CAB3	YKL088W	1716 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	DNF2	YDR093W	4839 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YDR114C	YDR114C	303 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	MAM1	YER106W	909 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YGR018C	YGR018C	330 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	RFU1	YLR073C	603 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	ERD2	YBL040C	660 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YNL146W	YNL146W	303 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	GIM3	YNL153C	390 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	MDG1	YNL173C	1101 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	TRS33	YOR115C	807 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	ECM23	YPL021W	564 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	SPN1	YPR133C	1233 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	MAG2	YLR427W	2013 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YDR131C	YDR131C	1671 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	TRM11	YOL124C	1302 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	CST9	YLR394W	1449 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	BSC1	YDL037C	987 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	UBC13	YDR092W	462 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	VMA21	YGR105W	234 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YVH1	YIR026C	1095 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	ATG27	YJL178C	816 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	RNP1	YLL046C	750 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	NMA1	YLR328W	1206 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	MRPL3	YMR024W	1173 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YMR082C	YMR082C	357 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YSF3	YNL138W-A	258 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	YOR029W	YOR029W	336 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	ARG4	YHR018C	1392 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	ACA1	YER045C	1470 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	THI20	YOL055C	1656 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	TPS3	YMR261C	3165 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	SWC3	YAL011W	1878 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	AGE1	YDR524C	1449 nt		4.21	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	CDC37	YDR168W	1521 nt		4.21	□□□□□ -1.73
MSL5	Q12186	CAF4	YKR036C	1932 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	MCM2	YBL023C	2607 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	PEX10	YDR265W	1014 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	MIG3	YER028C	1185 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	YKR011C	YKR011C	1062 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	JLP1	YLL057C	1239 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	COQ9	YLR201C	783 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	SYM1	YLR251W	594 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	YLR252W	YLR252W	306 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	YLR400W	YLR400W	474 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	IGO1	YNL157W	507 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	ATX2	YOR079C	942 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	NIP7	YPL211W	546 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	YPR174C	YPR174C	666 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	GLT1	YDL171C	6438 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	RSC58	YLR033W	1509 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	FRT2	YAL028W	1587 nt		4.2	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	YCL076W	YCL076W	744 nt		4.2	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	BMH2	YDR099W	822 nt		4.2	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	UBC8	YEL012W	657 nt		4.2	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	SSY5	YJL156C	2100 nt		4.2	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		4.2	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	PRX1	YBL064C	786 nt		4.2	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	CUZ1	YNL155W	825 nt		4.2	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	BRX1	YOL077C	876 nt		4.2	□□□□□ -1.74
MSL5	Q12186	AZR1	YGR224W	1842 nt		4.2	□□□□□ -1.74

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