Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 DER1YBR201W 636 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 CTM1YHR109W 1758 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 TDA1YMR291W 1761 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 XRS2YDR369C 2565 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 RPN4YDL020C 1596 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 PGS1YCL004W 1566 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 BUD27YFL023W 2391 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 VPS53YJL029C 2469 nt3.75□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 AEP3YPL005W 1821 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 SPT6YGR116W 4356 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 NUP159YIL115C 4383 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 BSC1YDL037C 987 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 SDS23YGL056C 1584 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 YGR026WYGR026W 837 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 GEP4YHR100C 558 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 GMH1YKR030W 822 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 YLR311CYLR311C 348 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 OXR1YPL196W 822 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 RPS9BYBR189W 588 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 MSD1YPL104W 1977 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 UBX5YDR330W 1503 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 RRN7YJL025W 1545 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 YIG1YPL201C 1386 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 RRN6YBL014C 2685 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 GPI13YLL031C 3054 nt3.74□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 TRS120YDR407C 3870 nt3.73□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 MEK1YOR351C 1494 nt3.73□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 ZDS1YMR273C 2748 nt3.73□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 DBP5YOR046C 1449 nt3.73□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 TRX3YCR083W 384 nt3.73□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 PDX1YGR193C 1233 nt3.73□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 SOL3YHR163W 750 nt3.73□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 POP8YBL018C 402 nt3.73□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 MED11YMR112C 396 nt3.73□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 MRPL51YPR100W 423 nt3.73□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 YGL140CYGL140C 3660 nt3.73□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 KIN3YAR018C 1308 nt3.72□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 FAD1YDL045C 921 nt3.72□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 RPL35BYDL136W 363 nt3.72□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 BSC2YDR275W 708 nt3.72□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 WBP1YEL002C 1293 nt3.72□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 AIR1YIL079C 1083 nt3.72□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 YNL171CYNL171C 369 nt3.72□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 LDH1YBR204C 1128 nt3.72□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 PLM2YDR501W 1566 nt3.72□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 SEC59YMR013C 1560 nt3.72□□□□□ -1.81
VPS54Q12071 LSM12YHR121W 564 nt3.71□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 MRPL49YJL096W 486 nt3.71□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 SAW1YAL027W 786 nt3.71□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 TMA19YKL056C 504 nt3.71□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 MYO3YKL129C 3819 nt3.71□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 REH1YLR387C 1299 nt3.71□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YNL035CYNL035C 1170 nt3.71□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 ALG1YBR110W 1350 nt3.71□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 APE2YKL157W 2859 nt3.71□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 MAL12YGR292W 1755 nt3.71□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 MAL32YBR299W 1755 nt3.71□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YPR148CYPR148C 1308 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YGR117CYGR117C 1431 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 DAP2YHR028C 2457 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YOR022CYOR022C 2148 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 SEC53YFL045C 765 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 MTC3YGL226W 372 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YJR071WYJR071W 369 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 MBR1YKL093W 1020 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YPT7YML001W 627 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 IZH4YOL101C 939 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 PFK27YOL136C 1194 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 ATG5YPL149W 885 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 CEX1YOR112W 2286 nt3.7□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 CAF130YGR134W 3369 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 SLM2YNL047C 1971 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 TRP4YDR354W 1143 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 PCL7YIL050W 858 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 AUR1YKL004W 1206 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YML047W-AYML047W-A 366 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 MOH1YBL049W 417 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 RRG9YNL213C 645 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 MRP2YPR166C 348 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 ARA1YBR149W 1035 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 ELM1YKL048C 1923 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 TSR1YDL060W 2367 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 CUE3YGL110C 1875 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 NEM1YHR004C 1341 nt3.69□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 OAF3YKR064W 2592 nt3.68□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 MNT4YNR059W 1743 nt3.68□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt3.68□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YAL004WYAL004W 648 nt3.68□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 HOT13YKL084W 351 nt3.68□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YOL118CYOL118C 309 nt3.68□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 RPN8YOR261C 1017 nt3.68□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 FDH1YOR388C 1131 nt3.68□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 APN2YBL019W 1563 nt3.68□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 HFD1YMR110C 1599 nt3.68□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 STU1YBL034C 4542 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 LRG1YDL240W 3054 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 MIC60YKR016W 1623 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 NUF2YOL069W 1356 nt3.67□□□□□ -1.82
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