Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms