Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD3Q0VAK6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD3Q0VAK6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD3Q0VAK6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms