Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms